Grafika pro protokol je rozdelena opet do dvou casti - cast spolecna pro vsechny aplikace (Hlavni titulek, Podtitulek) a cast, kterou si muze definovat kazda aplikace sama (PlastProtocolPane). Nastaveni protokolu je vazana na ExperimentType.

Celou zalozku zastituje controller SettingsProtocolTabController, ktery v sobe obsahuje ExperimentProtocolPaneController, ktery si jiz definuje kazda aplikace sama. Jedna se o jednoduchy interface

public interface ExperimentProtocolPaneController extends Initializable, Savable {
  public void load(ExperimentType experiment);
}

Tento controller je predavan prostrednictvim ExperimentTypeGraphicFactory nasledujici metodou

public GraphicControllerDTO getProtocolGraphic();